Pelabuhan Penyeberangan Mokmer terletak di Kabupaten Biak, Provinsi Papua dan memiliki luas 13.969,446 m2 . Pelabuhan ini dibangun pada tahun 2002 dengan menggunakan dana APBN dan merupakan aset milik Kementerian Perhubungan. Profil dan Gambaran Umum Pelabuhan Penyeberangan Mokmer saat ini beroperasi melayani rute perjalanan sebanyak 3 lintasan yaitu Biak-Manokwari (PP), Biak-Yapen-WarenNabire (PP) dan Biak-Teba-Bagusa-Trimuris-Kasonaweja (PP). Lintasan tersebut masing-masing dilayani oleh KMP. Kasuari Pasifik IV, KMP. Masirei dan KMP. Mamberamo Foja