Satuan Pelayanan Pelabuhan Penyeberangan Pantai Baru/Rote terletak di Kabupaten Rote Ndao yang memiliki 1 unit dermaga dengan sistem bongkar muat moveable bridge dab plengsengan. Dermaga di Pelabuhan Penyeberangan Pantai Baru/Rote bertipe dolphin yang terdiri dari 3 breasting dolphin dan 3 mooring dolphin. Fasilitas darat dari Pelabuhan Penyeberangan Pantai Baru/Rote terdiri dari gedung terminal dan kantor pengelola, lapangan parkir kendaraan, dan kantin. Pelabuhan Penyeberangan Pantai Baru/Rote dikelola oleh PT. ASDP Indonesia Ferry (Persero) yang dibangun pada tahun 1992.